АПМП ЕАЭС создана в рамках Таможенного союза России, Белоруссии и Казахстана, объединяет ведущие предприятия масложирового комплекса и смежных с ним отраслей, а также научные учреждения стран Таможенного союза.
Основными задачами Ассоциации являются участие в разработке и реализации программ развития масложирового комплекса Таможенного союза, подготовка предложений по внесению в установленном порядке законодательных и иных нормативных актов, направленных на защиту прав и интересов производителей масложировой продукции, содействие в развитии интеграционных связей и межотраслевой кооперации предприятий - членов Ассоциации с предприятиями стран - членов ЕАЭС, СНГ и других стран.
Деятельность Ассоциации способствует техническому перевооружению предприятий - членов ассоциации, сохранению и совершенствованию производственно-технологических связей между членами ассоциации и остальными участниками рынка масложировой продукции, решению задач, поставленных в Доктрине продовольственной безопасности.